Финансовая сфера

В 1994—1997 годах Михаил Моторин работает консультантом, заведующим сектором и затем — руководителем аппарата Комитета по бюджету, налога, банкам и финансам Государственной Думы. В декабре 1997 становится заместителем министра финансов РФ. В мае 2004 года оставляет пост заместителя министра и возглавляет департамент налоговой и таможенно-тарифной политики Минфина, остается членом коллегии Минфина РФ.

В 2007 году возглавил департамент финансового планирования и финансирования Министерства обороны РФ.

С декабря 2009 по февраль 2019 года Михаил Моторин занимал должность первого заместителя генерального директора — финансового директора ООО СК «ВТБ Страхование», с марта 2010 по февраль 2019 года входил в состав правления компании.

С 26 марта по 5 июня 2013 года временно исполнял обязанности президента Всероссийского союза страховщиков. С февраля 2019 года — исполняющий обязанности генерального директора НПФ «Открытие», позже — генеральный директор. В начале 2023 года покинул НПФ «Открытие».