18 апреля 1994 года распоряжением Госкомимущества № 840-р было утверждено Положение о реестре акционеров акционерного общества — первый ведомственный документ, регламентирующий регистраторскую деятельность.

После него стали появляться новые фирмы — специализированные регистраторы. Так как в положении было четко сказано: «Брокер и реестродержатель не совместимы, если речь идет об одном эмитенте», то ряд брокерских контор тогда выделили реестродержателей в отдельные структуры.

В 1997 году готовились документы, регламентирующие различные стороны рынка ценных бумаг.

Федеральная комиссия по рынку ценных бумаг (ФКЦБ), чтобы формально соблюсти договоренность о согласовании с Банком России готовящихся документов, прислала на Неглинку ряд нормативных положений, регулирующих брокерскую и дилерскую деятельность на рынке ценных бумаг, а также депозитарное обслуживание. Они поступили на согласование в ЦБ за день до их официальной публикации, однако Андрей Козлов не захотел их визировать.

Первый вице-премьер правительства Анатолий Чубайс взялся наладить отношения между враждующими сторонами.

Так, 18 апреля 1997 года, под вечер он вызвал руководителей ФКЦБ и Банка России для обсуждения вопросов взаимодействия на рынке ценных бумаг. В Белом доме лицом к лицу встретились руководитель комиссии Дмитрий Васильев, первый зампред Центробанка Сергей Алексашенко и зампред ЦБ Андрей Козлов.

Чубайс дал задание руководителям ведомств в трехнедельный срок «восстановить взаимопонимание и найти компромисс по всем имеющимся вопросам». Также он настоятельно рекомендовал ЦБ и ФКЦБ «не выносить мусор из избы» и прекратить публичные склоки, перестать поливать друг друга грязью в СМИ .

За два года до этого Чубайс уже проводил у себя подобное совещание. Тогда же в неофициальной беседе было решено, что Банк России будет регулировать рынок гособлигаций, ФКЦБ — рынок корпоративных бумаг. Однако стороны не оговорили немаловажную проблему — положение и роль коммерческих банков на фондовом рынке...

Представители ЦБ РФ и Минфина открыто заявляли о необходимости лишить ФКЦБ части полномочий, данных ей Президентом России для регулирования и контроля за российским рынком ценных бумаг. В частности, Олег Вьюгин из Минфина и Сергей Егоров из АРБ предлагали при разрешении участия банков на фондовом рынке передать права лицензирования и контроля за их деятельностью от ФКЦБ к ЦБ. При этом ФКЦБ смогла бы в нормативных рамках регулировать деятельность банков на фондовом рынке только через ЦБ РФ.